Kogoro Mouri menerima sepucuk surat yang isinya mengharapkan bantuan. Akhirnya bertiga dengan Conan dan ran, mereka menuju sebuah rumah yang banyak terdapat jam aneh. Antara angka 0, terdapat goresan, seperti sandi. Pada saat jam 1.10...sebuah jam kukuk berbunyi dan tiga buah patung setan dengan tulisan L,N,R di kepalanya.
Conan diajak pergi ke rumah mantan atasan Kogoro sewaktu masih di kepolisian. Saat itu, tanpa diduga terjadi kasus pembunuhan yang tidak sengaja dilakukan mantan atasan Kogoro tsb. Dapatkah Conan memecahkan kasus ini?
Hari Valentine, hari cokelat. Conan ikut Ran dan Sonoko ke vila di gunung untuk ikut kursus membuat cokelat Valentine. Saat badai salju mulai bertiup, angin kematian terasa menusuk tulang. Cokelat Valentine lambang cinta menjadi alah satu bukti pembunuhan di hutan...
Seorang murid pindahan yang aneh datang. Dia mengetahui identitas Conan yang sebenarnya. PAda saat yang bersamaan, terjadi kasus pemalsuan uang disusul dengan pembunuhan seorang profesor. Conan tidak tahu, gadis kecil misterius itu kawan atau lawan. Siapa namanya yang sebenarnya?
Ancaman bom masuk ke kepolisian saat pawai kemenangan Tim Tokyo Spirits berlangsung. Di setiap sudut kota berjaga polisi yang menyamar. Di tengah keramaian itu, seseorang merebut kamera video milik Mitsuhiko. Dan tiba-tiba mobil milik Takagi meledak...
Pembunuhan terjadi di rumah penduduk di pedalaman gunung tempat grup detektif cilik menginap. Apakah itu perbuatan nenek yang mirip penyihir yang tinggal di rumah itu? Selain itu, masa lalu murid pindahan yang bernama Eisuke Hondo, semakin jelas.
Detektif kecil Conan Edogawa sebenarnya adalah detektif SMU ternama Sinichi Kudo. Sambil mengejar organisasi hitam yang telah membuat tubuhnya menjadi anak kecil, Conan memecahkan berbagai kasus sulit. Pada tiap-tiap volume buku ini terdapat cerita kasus2 yang berbeda yg dipecahkan Conan yang membantu Detektif Kogoro Mouri ayah Ran.
Sinichi Kudo adalah seorang detektif SMU yang terkenal. Dia diberi minum racun oleh organisasi misterius sehingga badannya mengecil. Untuk menyembunyikan identitasnya dia memakai nama sementara "Conan Edogawa". Sambil diam-diam menolong detektif plin-plan Kogoro Mouri memecahkan kasus yang sulit dia mengejar kawanan pria berjubah hitam.
Rena Mizunashi masuk ke rumah sakit dalam keadaan koma di bawah pengawasan FBI. Di sekelilingnya dibayangi bayangan hitam. Eisuke Hondo berhasil menyelinap dan memperlihatkan jati dirinya. Ada juga kasus pembunuhan sang Iblis dan pembunuhan dari Yomi